La Unidad de Estadística y Bioinformática: un caso de éxito

Cada vez es más habitual y necesario que los centros sanitarios y hospitalarios tengan una unidad o equipo destinado a la gestión de los datos. El caso concreto que revisamos en esta entrada es el de la Unidad de Estadística y Bioinformática (UEB) del Vall d’Hebron Institut de Recerca (VHIR), la cual está liderada por el Dr. Santiago Pérez Hoyos.

Esta unidad está formada por un equipo de 10 personas, 6 de las cuales se han graduado del máster universitario de Bioinformática y Bioestadística UOC-UB y otras 3 personas están colaborando en la docencia del máster en cuestión. Así pues, hemos aprovechado esta ocasión para hablar directamente con algunas de ellas para que nos expliquen las tareas que están desarrollando en la unidad, qué conocimientos del máster les han sido útiles para su actividad profesional y su valoración personal del máster.

Esther Camacho: «La experiencia del máster me ha servido para aprender los conceptos básicos de los lenguajes de programación R, Python i HTML»

Esther nos cuenta que en la Unidad de Estadística y Bioinformática lleva a cabo principalmente análisis bioinformáticos y alguno de bioestadística. Normalmente, los proyectos son de RNA-seq o de microarrays y pertenecen a análisis para la investigación clínica donde el organismo modelo suele ser humano o ratón.

En cuanto a la experiencia adquirida en el máster que le ha servido para su trayectoria profesional, destaca los conceptos básicos de los lenguajes de programación en R, Python y HTML. Actualmente, en la UEB usa básicamente R, pero nos cuenta que en su anterior puesto de trabajo, en el Centro de Biología Molecular Severo Ocho CSIC-UAM también trabajava con Linux y codificaba con Python. Allí también se encargó de crear la web del laboratorio codificada en HTML. Además, Esther también destaca los conceptos dados en las clases de bioestadística, los cuales considera muy importantes.

Por último, en referencia a su valoración personal del máster, Esther nos cuenta que está muy satisfecha. Por una parte, porque el formato online le permitió compaginar trabajo y estudios, formándose en bioinformática, hecho que le permitió hacer un salto cualitativo en su carrera profesional. Por otra parte, porque considera que es un máster muy completo, que explica y aplica conceptos que no se profundizan demasiado en los estudios de licenciatura (en su caso, Esther estudió una licenciatura en biotecnología).

Guillem Fernández: «El máster me ha permitido adquirir los conocimientos técnicos necesarios para poder empezar mi carrera profesional dentro del ámbito del data management y la bioestadística clínica»

Guillem es el Data Manager encargado de dar soporte técnico a los investigadores del Campus Vall d’Hebron que necesitan reutilizar datos clínicos para proyectos y estudios de investigación. Guillem nos cuenta que las tareas que realiza en la Unidad de Estadística y Bioinformática son la extracción, preparación, entrega y análisis de los datos almacenados en los Sistemas de Información del Hospital Universitari Vall d’Hebron.

Referente a los conocimientos adquiridos en el máster y que le han sido de gran ayuda para el desarrollo de su actividad profesional, Guillem destaca los siguientes:

• Programación en los lenguajes R, SQL y Python para la gestión y análisis de grandes conjuntos de datos.
• Inferencia estadística, regresión y análisis de datos multivariante para estudios de investigación clínica.

Finalmente, le pedimos a Guillem que nos dé una valoración personal del máster y nos explica que está muy satisfecho de haber cursado este máster, ya que le ha permitido adquirir los conocimientos necesarios para empezar su carrera profesional dentro del ámbito del data management y la bioestadística clínica. Además, nos destaca los siguientes puntos por los que volvería a elegir de nuevo este máster:

• La variedad de los conocimientos impartidos
• La flexibilidad de la modalidad online
• La posibilidad de realizar prácticas externas en hospitales y centros de investigación que te permiten tener un primer contacto con la gestión y análisis de datos en un entorno real.

Mireia Ferrer: «El formato online fue ideal para mí, ya que pude aprovechar mi etapa en México para seguir desarrollándome y reorientar mi carrera profesional»

Mireia es la responsable de la Plataforma de Bioinformática en la Unidad de Estadística y Bioinformática. Mireia nos cuenta que en su día a día realiza análisis bioinformáticos y estadísticos relacionados principalmente con datos ómicos (NGS, microarray, HT-qPCR…) y clínicos, así como también se encarga de la vigilancia tecnológica y desarrollo de nuevas herramientas y procedimientos (pipelines) relacionados con la bioinformática. Desde la UEB ayudan a los investigadores y médicos con el diseño experimental de los proyectos para que puedan tener en cuenta los distintos factores que pueden afectar al análisis. Así pues, se encargan del análisis estadístico y bioinformático de los datos y realizan un informe con los resultados obtenidos.

Preguntada por la experiencia obtenida del máster para su actividad profesional, Mireia nos explica que el máster le permitió centrar-se en el análisis de datos y profundizar en análisis estadístico y bioinformático del gran volumen de datos que se generan en los proyectos de investigación y que suelen quedar infrautilizados.  Mireia también nos da su visión sobre las dos disciplinas que combina el máster, la bioinformática y bioestadística, campos que considera con mucho futuro laboral, ya que las nuevas tecnologías permiten cada vez más obtener más datos y con menos costes, de forma que el análisis integrado de estos datos permitirá obtener respuesta a muchos problemas biomédicos.

Por último, en cuanto a su valoración personal del máster, Mireia nos comenta que está muy satisfecha con el máster y que destaca los siguientes puntos:

• La modalidad online, que le permitió seguir desarrollándose y reorientar su carrera profesional durante su etapa en México.
• La preparación profesional del equipo docente.
• La metodología docente usada, que permite potenciar la autonomía del estudiante y el desarrollo de distintas áreas de conocimiento según sus intereses.
• La combinación de parte teórica y práctica, así como la variedad de recursos de aprendizaje que permite cubrir las necesidades propias de cada estudiante.

Esperamos que muchos de nuestros titulados estén teniendo un impacto en nuestra sociedad como los que os acabamos de contar en esta entrada y animaros a los que nos estéis leyendo y tengáis interés en este campo a matricularse en el máster universitario de Bioinformática y Bioestadística UOC-UB. En caso de que no tengáis un interés específico en los datos de carácter biológico, sino en el análisis de datos de carácter general, recomendaros esta entrada de nuestro blog, donde encontraréis las opciones formativas en la UOC en ciencia de datos.